Некоторые импортные товары, например относящиеся к разряду важнейших и жизненно необходимых медицинских изделий, освобождаются от уплаты НДС при ввозе на таможенную территорию РФ. Принадлежность товаров к вышеуказанному разряду определяется в соответствии с Перечнем медицинских товаров, ввоз которых не облагается НДС (утвержден Постановлением Правительства РФ от 30.09.2015 № 1042).
Вместе с тем, в настоящее время таможенные органы нередко отказывают медицинским компаниям – декларантам в предоставлении льготы по НДС под разными предлогами. Основаниями для отказа может стать предоставление декларантом Регистрационного удостоверения нового образца, ввоз медицинских изделий не в полном комплекте, указанном в Регистрационном удостоверении, ввоз отдельных принадлежностей медицинского изделия без самого изделия, отличная от заявленной декларантом классификация изделия по ТН ВЭД и др.